GENETIC_CODE
from Biostrings
extended by codon
number and number of syn sites.
codon2number(codon)
codon
[mandatory]
An object of class numeric
GENETIC_CODE_TCAG
#> CODON GENETIC_CODE CODON_NUMBER SYN_SITES
#> TTT TTT F 1 1
#> TTC TTC F 2 1
#> TTA TTA L 3 2
#> TTG TTG L 4 2
#> CTT CTT L 5 3
#> CTC CTC L 6 3
#> CTA CTA L 7 4
#> CTG CTG L 8 4
#> ATT ATT I 9 2
#> ATC ATC I 10 2
#> ATA ATA I 11 2
#> ATG ATG M 12 0
#> GTT GTT V 13 3
#> GTC GTC V 14 3
#> GTA GTA V 15 3
#> GTG GTG V 16 3
#> TCT TCT S 17 3
#> TCC TCC S 18 3
#> TCA TCA S 19 3
#> TCG TCG S 20 3
#> CCT CCT P 21 3
#> CCC CCC P 22 3
#> CCA CCA P 23 3
#> CCG CCG P 24 3
#> ACT ACT T 25 3
#> ACC ACC T 26 3
#> ACA ACA T 27 3
#> ACG ACG T 28 3
#> GCT GCT A 29 3
#> GCC GCC A 30 3
#> GCA GCA A 31 3
#> GCG GCG A 32 3
#> TAT TAT Y 33 1
#> TAC TAC Y 34 1
#> TAA TAA * 35 2
#> TAG TAG * 36 1
#> CAT CAT H 37 1
#> CAC CAC H 38 1
#> CAA CAA Q 39 1
#> CAG CAG Q 40 1
#> AAT AAT N 41 1
#> AAC AAC N 42 1
#> AAA AAA K 43 1
#> AAG AAG K 44 1
#> GAT GAT D 45 1
#> GAC GAC D 46 1
#> GAA GAA E 47 1
#> GAG GAG E 48 1
#> TGT TGT C 49 1
#> TGC TGC C 50 1
#> TGA TGA * 51 1
#> TGG TGG W 52 0
#> CGT CGT R 53 3
#> CGC CGC R 54 3
#> CGA CGA R 55 4
#> CGG CGG R 56 4
#> AGT AGT S 57 1
#> AGC AGC S 58 1
#> AGA AGA R 59 2
#> AGG AGG R 60 2
#> GGT GGT G 61 3
#> GGC GGC G 62 3
#> GGA GGA G 63 3
#> GGG GGG G 64 3